Jak enzymy fungují? Studium kinetiky a mechanismu enzymů

Vedení

Abstrakt

Proč studovat mechanismus enzymových reakcí? Řada onemocnění souvisí s pozměněnou funkcí životně důležitých enzymů. Znalost mechanismu je důležitá pro vývoj nových léčiv a léčebných postupů. Enzymy jsou rovněž široce využívány v průmyslu, potravinářství a zemědělství a znalosti jejich fungování umožňují cílené inženýrství pro moderní průmyslové biotechnologie. Práce bude zaměřena na využití moderních metod tranzitní kinetiky pro studium mechanismů enzymové katalýzy a vazbu inhibitorů. Budou studovány důležité vědecké problémy, např. role molekulárních tunelů a bran v biokatalýze; vliv dynamiky a solvatace na rychlost enzymové reakce. Díky multidisciplinárnímu pojetí výzkumu v Loschmidtových laboratořích bude projekt zahrnovat i expertízu strukturní analýzy a počítačového modelování. Student bude vyškolen v metodách rychlého mísení „stopped-flow“ a „quench-flow“, které umožňují pozorovat počáteční stavy reakcí v časovém okně kratším než jedna milisekunda. Získaná komplexní kinetická data budou hodnocena softwarovými nástroji využívající numerické simulace. Výsledkem projektů budou nové znalosti fungování enzymů, popis mechanismu a strukturní podstaty studovaných dějů. Nové poznatky budou využity k proteinového inženýrství enzymů pro jejich aplikace v moderních biotechnologiích a k vývoji nových léčiv.

Jak enzymy fungují? Studium kinetiky a mechanismu enzymůJak enzymy fungují? Studium kinetiky a mechanismu enzymů

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Reference

Financování

Projekt je podporován grantem Ministerstva školství České republiky.

Gaspar a Gaussian Expert
1st Hands-on Computational Enzyme Design Workshop
Marie Curie Fellowship for Dmitri
Rayyan Announced as Best Presenter
Researchers’ Night 2019 in LL
Open Postdoctoral Position: Protein Structural Biologist
Andrea Awarded for Excellent Research