Jak enzymy fungují? Studium kinetiky a mechanismu enzymů

Vedení

Abstrakt

Proč studovat mechanismus enzymových reakcí? Řada onemocnění souvisí s pozměněnou funkcí životně důležitých enzymů. Znalost mechanismu je důležitá pro vývoj nových léčiv a léčebných postupů. Enzymy jsou rovněž široce využívány v průmyslu, potravinářství a zemědělství a znalosti jejich fungování umožňují cílené inženýrství pro moderní průmyslové biotechnologie. Práce bude zaměřena na využití moderních metod tranzitní kinetiky pro studium mechanismů enzymové katalýzy a vazbu inhibitorů. Budou studovány důležité vědecké problémy, např. role molekulárních tunelů a bran v biokatalýze; vliv dynamiky a solvatace na rychlost enzymové reakce. Díky multidisciplinárnímu pojetí výzkumu v Loschmidtových laboratořích bude projekt zahrnovat i expertízu strukturní analýzy a počítačového modelování. Student bude vyškolen v metodách rychlého mísení „stopped-flow“ a „quench-flow“, které umožňují pozorovat počáteční stavy reakcí v časovém okně kratším než jedna milisekunda. Získaná komplexní kinetická data budou hodnocena softwarovými nástroji využívající numerické simulace. Výsledkem projektů budou nové znalosti fungování enzymů, popis mechanismu a strukturní podstaty studovaných dějů. Nové poznatky budou využity k proteinového inženýrství enzymů pro jejich aplikace v moderních biotechnologiích a k vývoji nových léčiv.

Jak enzymy fungují? Studium kinetiky a mechanismu enzymůJak enzymy fungují? Studium kinetiky a mechanismu enzymů

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Reference

Financování

Projekt je podporován grantem Ministerstva školství České republiky.

New Version of CAVER PyMOL Plugin
New Website of SinFonia Project
Congratulations to Katka on her BA’s Degree
Hanka’s Success at a Student Conference
KinTek Workshop First Time in Europe
Open Postdoctoral Position: Protein Structural Biologist
Pavel Vanacek and Antonin Kunka Awarded by Dean